飼養過程中，蚯蚓的天敵有鼠、蛙、蛇等。在惡劣的環境條件下如梅雨季節、暴雨及悶熱的夏季蚯蚓會逃跑，做好排水工程和防暑降溫工作很重要。
蟲害防治；
飼養過程中，蚯蚓的天敵有鼠、蛙、蛇等。在惡劣的環境條件下如梅雨季節、暴雨及悶熱的夏季蚯蚓會逃跑，做好排水工程和防暑降溫工作很重要。此外，飼養密度過大也會引起逃逸。因此，定期檢查、適時分養和收取成蚓，不僅能有效防止逃逸，還能顯著提高蚯蚓產量。
食鹽中毒；
此症發病急，經激烈掙紮後很快麻痹僵硬，色澤趨白。防治方法：立即清除發病基料，並用大量淨水清洗，麵積大且嚴重的可把基料連蚯蚓一同浸入淨水中，待蚯蚓不掙紮時取出蚯蚓待自然蘇醒後放上新鮮基料重新飼喂。
胃酸症；
本病表現蚯蚓痙攣狀結節、環帶紅腫、身體變短粗、轉圈爬行或鑽到底部不食不動，全身變白死亡，有斷節現象。防治方法：立即掀開蚓床覆蓋物通風，同時噴灑蘇打水或1%新鮮石灰水中和。
缺氧症；
本病蚓體色灰暗無光、體弱、行動遲緩，是缺氧所致。防治方法：揭去蚓床覆蓋物通風、檢查基料幹濕程度並調整到目的幹濕度改用腐熟好的基料飼喂。
病害；
蚯蚓的病害主要有：細菌、真菌、病毒三大類。生產中要經常觀察群體發育情況，隻要發現體軟或體硬、變色、有惡臭味、體色異常的個體應及時淘汰，群體發病的要整體淘汰。實踐證明采取適當降低蚓群密度，勤除薄飼，分期飼養，保持良好的飼養環境等措施，是提高蚯蚓抗病能力獲得高產的關鍵。生產中應在飼料中添加0.01%土黴素或定期用0.01%土黴素噴灑飼養床麵。
養殖過程中要及時清除蚯蚓糞便，清理蚯蚓糞便的目的是減少蚓床的堆積物和收獲成蚓，一般1個月清理1次。清除糞便後要及時添加新飼料，以保證飼料充足。
蚯蚓被稱為“環保衛士”，處理城鄉垃圾；它排出的糞便不僅是優質的有機肥料，還是喂養畜禽魚蝦的高蛋白質飼料。
