金魚藻是被子植物，因爲植株本身具有維管束，分化出了根莖葉，並且帶有種子，依靠種子進行繁殖，是懸浮在水中的多年水生草本植物，具有一般藻類植物不具備的特徵。金魚藻莖部長度在40～150釐米間，莖部平滑，具有較多的分枝。花朵直徑在2毫米左右。