睡蓮根還可進行冷凍保存，可將修剪完成的睡蓮根，放置到通風透氣的容器內，放入冰箱中進行冷藏，溫度控製在5℃左右，周圍溼度控製在60%以上。進行冷凍的睡蓮能保存100天左右，等春季氣溫回暖後便可取出，重新栽種入土。