枯草芽孢杆菌施入土壤後有一個菌群繁殖壯大的過程，因此，要在發病前或作物根係開始生長前使用才能達到控製病害的目的。避免與未腐熟的農家肥混用；與未腐熟的農家肥施入地裏會產生二次發酵升溫，高溫會殺死枯草芽孢杆菌，影響菌種的繁殖殺菌治病。
枯草芽孢杆菌的使用方法
1、拌種使用：
在西瓜、黃瓜、番茄、茄子等蔬菜播種前，用300億芽孢/毫升枯草芽孢杆菌懸浮種衣劑按照藥種比1：50～100的比例進行拌種，包衣後能在種子外部形成一層有益菌的保護層，可以抑製枯萎病、根腐病等土傳病菌對種子的侵染，並且在植物根際、體表或體內及土壤中快速、大量繁衍和定殖，保護植株不受病菌侵染，同時分泌具有殺菌作用的活性物質，達到有效排斥、抑製和殺滅病菌的作用。
2、噴霧：
防治赤星病、稻瘟病、黑脛病、枯萎病、黃萎病等病害，可在發病初期，用枯草芽孢杆菌2000億CFU/克枯草芽孢杆菌可濕性粉劑7.5-10克/畝，兌水30公斤均勻噴霧，每7天噴一次，連噴2～3次。
3、灌根處理：
在黃瓜、西瓜、番茄、茄子等枯萎病發生前或發生初期，用100億個/克枯草芽孢杆菌可濕性粉劑200-250克/畝，加水進行灌根。
枯草芽孢杆菌的特點
枯草芽孢杆菌在土溫10～40℃範圍內能夠正常生長繁殖，在10-24℃生長繁殖較緩慢，並隨著溫度增高而繁殖加快，25～37℃最適宜生長繁殖，在碳源充足（也就是有機質豐富）時約20--30分鍾繁殖一代，當溫度超過48℃後生長繁殖受到抑製。枯草芽孢杆菌最適宜的土壤濕度為60%左右，所以寒冷的冬季盡量不要使用，也不要在過分幹旱時環境條件下使用。
枯草芽孢杆菌對於陽光中的紫外線敏感，容易將其殺死，因此不要在陽光暴曬的中午使用，也不能直接撒施在地表，要在陰天或清晨、傍晚噴霧，或用於土壤處理和灌根使用。
