農業麵源汙染是指農村地區在農業生產過程中產生的、未經合理處置的汙染物對水體、土壤和空氣及農產品造成的汙染，主要包括化肥汙染、農藥汙染和畜禽糞便汙染等，來源主要是農業生產過程中不合理使用而流失的農藥、化肥、殘留在耕地中的農用薄膜和處置不當的農業畜禽糞便、惡臭氣體以及不科學的水產養殖等產生的水體汙染物。
防治農業麵源汙染的方法如下：
1、嚴格控製農業用水總量。
通過采取節水農業包括農田基礎設施的建設，還有節水灌溉工程建設等措施，來提高水的利用效率。
2、減少化肥和農藥使用量。
大力推進測土配方施肥，包括病蟲害的綠色防控、綜合防控措施，精準施肥，減少農藥，化肥的使用量。
3、對廢棄物進行綜合循環再利用。
通過采取標準化養殖、清潔養殖，配套一些廢棄物的綜合處置設施，包括我們發展農村沼氣工程、發展循環農業，使廢棄物、糞便能夠得到更高的有效利用。
4、實行農膜的有效回收和處置以及循環利用。
現在農膜廣泛使用，這些農膜都容易老化，而且容易殘留在土壤當中。這就需要采取一些有效政策措施，來支持和激勵收儲和回收利用，減少汙染源。
5、加強監督管理。
農業麵源汙染是開放的，而且是跨流域的，是流動性的，所以流域上中下遊之間要加強協同監管。
6、強化法製建設。
積極參與推動國家正在做的土壤汙染防治法的製定，還有耕地質量保護條例的製定。同時，要加大對農業環境違法行為處罰的力度，健全重大環境事件和汙染事故的責任追究製度。
農業麵源汙染與有固定、可查究汙染源的點源汙染（如工業企業汙染）相比，時空範圍更廣、不確定性更大，成分、過程更複雜更難以控製。
