種植玉米時，選擇抗病品種，建議選育或引進高抗、高產且苞葉不易開裂的玉米品種，種植當地主推品種或新品種，可以有效防治玉米穗腐病的發生。
1、選擇抗病品種；
種植玉米時，選擇抗病品種，建議選育或引進高抗、高產且苞葉不易開裂的玉米品種，種植當地主推品種或新品種，可以有效防治玉米穗腐病的發生。
2、種子的選擇；
播種前對種子進行優選，去掉傷、病、弱、小種，選用籽粒飽滿，粒重較大，色澤純正的種子，優選後把種子放在強光下曬2～3天，進行殺菌消毒。然後對種子進行包衣，用藥劑包衣可以有效抑製病菌對種子的侵害，同時還能減少幼苗的染病幾率，防治地下害蟲對種子的破壞，起到保種促苗的作用。
3、合理密植；
根據不同品種選擇合理種植密度，緊湊型品種以4000株/畝左右為宜。及時清除田間病殘體，深耕深翻，實行輪作，適時早播，收貨後立即剝葉，通風向陽處風幹晾曬，定期翻動盡早脫粒。
4、水肥管理；
在玉米生長過程中，加強田間管理是尤為重要的環節，田間管理主要包括除草、施肥等。玉米生長的每一時期都要有充足的水分保證玉米正常的發育，從而增強玉米的抗病蟲害的能力；其次，合理施肥也很重要，減少氮肥的使用，增施有機肥，同時搭配鉀肥及磷肥的使用，並要適當追肥；最後，要及時清除田間雜草，避免雜草在田間吸收養分，影響玉米生長
5、適時收獲；
避開陰雨寡照天氣收獲；收獲後應及時充分晾曬；場地較小、堆放較集中的隔幾天翻倒1次防止捂黴；折斷病果穗黴爛頂部，防止穗腐病的進一步擴散；入倉後應做到自然通風、通氣，一般保持相對濕度在80%以下。
6、藥劑防治；
大喇叭口期用20%井岡黴素或40%多菌靈可濕性粉劑每畝200g點芯，預防病原菌侵染葉鞘和莖稈；在玉米吐絲期施用化學藥劑50%異菌脲、70%甲基托布津、50%苯醚甲環唑、240g/L噻呋酰胺和50%的苯並咪唑或施用生物藥劑5%井岡黴素，預防病原菌侵染果穗。
