由母體內的恒溫環境轉為變溫環境，由在無菌的胎盤中水生環境轉為有菌的豬舍陸生環境，由靠臍帶被動吸收來攝取養分轉為靠消化道主動吸收等。從哺乳舍轉到仔豬保育舍，所有這些都將從生理、營養、環境等方麵刺激仔豬，導致斷奶應激。
仔豬斷奶後除飼糧營養成分發生改變外，還要轉移圈舍，有時還要進行合群並窩。這些都會影響仔豬的內分泌係統、免疫狀態等生理機能。斷奶應激會引起仔豬胃腸道血管收縮，血供應量減少，胃腸道平滑肌舒張蠕動變緩，從而導致機體整體消化機能減弱，引起消化不良。
仔豬在斷奶前，其營養全部或部分由母乳提供，母乳中含有豐富的脂肪和易於消化的酪蛋白，且碳水化合物以乳糖為主，不含澱粉和纖維。而斷奶後，主要能量來源的乳脂被穀物澱粉所替代，可以完全被消化吸收的酪蛋白變成了消化率較低的植物蛋白，而纖維的存在更是讓仔豬難以承受。
這些變化對仔豬本就發育不完善的消化道酶係統無疑是雪上加霜，采食量下降、消化不良和腹瀉接踵而至。
