主要通過菌種傳播，水，土壤，品種等。
水稻稻瘟病的傳播途徑
病菌以分生孢子和菌絲體在稻草和稻穀上越冬。翌年產生分生孢子借風雨傳播到稻株上，萌發侵入寄主向鄰近細胞擴展發病，形成中心病株。病部形成的分生孢子，借風雨傳播進行再侵染。播種帶菌種子可引起苗瘟。適溫高濕，有雨、霧、露存在條件下有利於發病。
稻瘟病最合適的溫度是27℃左右，由當年的病菌寄宿在稻草上，這些病菌在幹燥的情況下能存活一年以上，在第二年天氣暖和後的7月份通過氣流傳播，落在新的水稻苗上，從而再次引發稻瘟。
品種的抗性因地區、季節、種植年限、生理小種而異。秈稻品種一般比粳稻品種好。同一品種在不同生長階段的抗性表現也不同。幼苗在4葉期、分蘖期和抽穗期易感病害，圓稈期病害輕，而同一器官或組織在幼嫩期病害重。穗初期抗病能力弱。過量施用氮肥對病害有利。早期或長期深灌導致根係發育不良，抗病能力弱，病情嚴重。
水稻稻瘟病的預防
預防途徑：選優質抗性強的種子來培育，提高抗病能力。施肥要適當，不能過量使用氮肥，過量使用氮肥會使抽穗不整齊，植株抗病能力減弱，有利於病害蔓延。做到早插秧，秧苗間隔合理，保證水稻之間日照足能通風，提高水稻的抗病能力。同時可以用藥物（比如春雷黴素）或者米醋對水稻稻瘟進行防治。
氣候是稻瘟發生的重要因素，雨水多濕度大日照少有利於稻瘟的發生，一定要及時注意災害性天氣監測，噴灑農藥時要選在天氣晴朗的日子，不能噴藥後遇到降雨，導致藥液流失，得不到及時的控製病菌，若藥液被雨水衝洗後等天晴一定要記得補噴。
