增加有機肥；有機肥能增加土壤的腐殖質，改善土壤的結構，可以使土壤中蓄存的養分充分釋放出來，能夠為水稻秧苗提供足夠的營養。此外，有機肥的施加，還能中和土壤中的堿性物質，使得土壤有更好的通氣透水效果。常見的有機肥如各類糞肥、圈肥、草肥等，在施加有機肥時還需要注意要充分腐熟後才能施用，避免水稻赤枯病的發生。
化肥與有機肥配合使用。兩者配合使用可以有效提高土壤肥力，同時還兼顧了土壤養分的速效性和長期性，達到用養結合的效果。建議不能使用含氯肥料，如氯化鉀，特別是重鹽堿地，以免有害離子增加。有條件的盡可能使用偏酸性、中性肥料，如硫酸銨、過石、尿素、硫酸鉀等。
增施微生物菌肥可以抵製有害病菌，減少水稻病害的幾率，同時在施加微生物菌肥之後可以減少其他肥料的成本投入，增加利潤效益。最主要的是微生物菌肥可以合理改善土壤板結、鹽堿化，平衡pH值，提高保水保肥能力，對於水稻的生長十分有利。
水稻插秧後施用底肥要點
水稻插秧後的施肥要點：插秧後7天左右，新根開始生長時，要追施返青肥，施肥量要根據地力而定，一般每畝施用尿素5千克左右。返青後進入分蘖期，分蘖肥要以氮肥為主，一般施肥量為10千克尿素。分蘖肥要早施，否則會引起水稻徒長。
在施肥的時候盡量采取側深施肥的方法，這樣施肥的第一個好處就是可以提高肥料的利用率，減少肥料的用量。第二就是可以促進水稻的生長和發育。第三就是可以減少水稻的患病率和減少環境汙染以及提高產量。在采用側深施肥的時候一定要注意水稻之間的距離、施肥比例以及稻田土壤等問題。
