牛油果的病害有很多，常見的有炭疽病、瘡痂病、尾孢斑點病和小穴殼果腐病。其中炭疽病會危害果實，使其長出凹陷的圓斑，需要通過低溫貯藏來防治。瘡痂病也會有病斑，不過不會影響果肉品質，可以用波爾多液治療。尾孢斑點病會導致果實開裂，從而讓其它病菌侵入，可用嘧菌酯防治。
一、炭疽病
這是牛油果的重要病害，它對果實的危害能力很強，同時也會感染葉子、花和嫩枝等。患病的果實會先長病斑，直徑一般不超過5毫米，形狀為圓形。之後病斑會逐漸擴大，而且還會向內凹陷。果實成熟後還會入侵果肉，導致其腐爛。發病期需要將患病的枝葉剪掉，以免其相互傳染。果實采收後需要進行低溫貯藏，運輸過程中還要避免損傷。
二、瘡痂病
這種病和炭疽病的情況類似，患病後會出現圓形褐色的突起，之後慢慢變成淺紫色的，等到果實成熟後，中間會凹陷，果皮也會變得粗糙。雖然這種病不會影響它的口味，但看上去很不美觀。在發病初期，葉子上會出現棕色斑點，表麵皺縮，此時需要將葉子剪除，以免情況繼續惡化。同時還要噴灑波爾多液，可以起到治療效果。
三、尾孢斑點病
尾孢斑點病主要危害葉子、莖和果實，被感染的果實表麵會形成枯斑，之後表皮會裂開，這樣會導致其它病菌侵入其中，導致果肉的腐敗。患病初期，葉子上會出現褐色的斑點，直徑在2-5毫米之間，之後變為紫色，而且會擴散到葉子兩麵，形狀也不規則。患病後要及時噴灑銅製劑和嘧菌酯，這樣就能有效防治。
四、小穴殼果腐病
這種病在初期會在果皮上出現紅色病斑，之後病菌會感染果實內部，果肉上會出現褐色條紋，果蒂周圍有紫褐色的病斑。等到它成熟後，病斑就會變黑凹陷，果實也會皺縮，表麵會覆蓋菌絲體，內部腐爛，並且會散發難聞的氣味。發現患病後，要立刻剪除患病的枝梢，將枯枝和病果清除，並且適當施肥，增加它的抗病能力。
