真牡丹根係比較多，大多為肉質主根和側根。假牡丹則根係比較少，甚至是蘿卜根係。真牡丹枝幹顏色比較深，假牡丹枝幹顏色比較淺。假的牡丹花開出花朵沒有真的牡丹花那樣花色鮮豔美麗，香味濃鬱。真牡丹花價格要比假牡丹貴很多。
一、根係不同
一般來說真牡丹根係比較多，大多為肉質主根和側根，初始根顏色為白色，之後變為黃色或褐色，肉質為白或紅色。若是假牡丹則根係比較少，一些甚至是蘿卜根係，且分布根係數量較少。
二、顏色不同
我們可以從顏色上區別出真假牡丹花，例如真牡丹枝幹顏色比較深，分枝是從根部產生的，呈叢生狀。而假牡丹枝幹顏色比較淺，且枝幹是獨幹，分枝是從主幹上產生的。
三、花朵不同
可以通過看花來分辨出真假牡丹，但是養殖到開花就是辨別真假也來不及了，所以實用性不是那麼大。假的牡丹花沒有真的牡丹花那樣花色鮮豔美麗，香味濃鬱。
四、價格不同
在市場上真牡丹花價格是比較貴的，例如幼苗可以在幾十到幾百不同，每個品種價格都不同。而假牡丹花則價格相對比較低廉，僅僅隻有幾塊或十幾塊。所以說一分價錢一分貨。
