分株：5月或9月中下旬選取3~4年生的植株，用刀將根莖分開，剪除殘根病根，每株保留3~4個芽，將葉片剪掉一部分，枝莖長25-30厘米左右進行栽植。播種：選擇當年生的種子，在溫水中浸泡6~8小時，將種子均勻撒播即可。
分株繁殖
分株可以保證品種的優良性狀，減少變異。
分株時間：
花菖蒲生長3~4年後可進行分株。通常選在春季5月進行，或者秋季9月中下旬或花後進行。北方地區，移栽時選在晴天，陽光充足的天氣進行。
分株方法：
首先，選取3~4年生的植株，用刀將根莖分開，剪除殘根病根，每株保留3~4個芽。夏秋季節分株時，將葉片剪掉一部分。枝莖長25-30厘米左右進行栽植。
花菖蒲的根莖會隨著時間增長逐年上升，栽種時根莖部分蓋土5cm以上，養護中適時加土。
分植後，適當澆水施肥，春植株叢當年可開花。
種子繁殖
播種時間：
播種繁殖是新品種的主要來源。在花期通過人工或自然雜交，植株結果，1月中旬可收獲種子，隨即播種。或者將種子放在0~4℃的環境下，第二年2~3月播種。9月中旬播種亦可。
播種方法：
選擇當年生的種子，在溫水中浸泡6~8小時，加快萌芽。
保證溫度控製在15~25℃，將種子均勻撒在土中，蓋上2~3cm土壤，30~40天即可出苗。待小苗長到10cm以上可以在上盆。
播種的花菖蒲在溫室中，生長緩慢，但小苗會常保綠色。冬季溫室播種，植株可不休眠越冬，並且開花早一年。
