準備好新鮮兔糞和秸稈、園林垃圾、菌菇渣等輔料，按照7:3的比例混合在一起，再添加一定量的發酵菌劑。
兔糞發酵方法：
準備好新鮮兔糞和秸稈、園林垃圾、菌菇渣等輔料，按照7:3的比例混合在一起，再添加一定量的發酵菌劑。秸稈和園林垃圾如果塊頭比較大，需要先粉碎。物料經過24-48小時的發酵，會快速升溫，這時要及時翻拋，以增加中間和底部物料的通風量和氧氣量。
此後根據兔糞堆體的溫度，每2-3天翻拋一次。等到堆體溫度不再升高，開始下降時，就不用再翻拋了。經過35天左右，兔糞就會發酵腐熟完成，可以稱為兔糞有機肥。發酵好的兔糞無臭味，顏色呈褐色和灰褐色，堆體溫度不再有變化。
用作物秸稈等原料發酵為主時可填加20%左右的畜禽糞便，用畜禽糞便為主做原料時可填加20%左右的秸稈粉，發酵方法同上所述。如果用酸性較大的原料發酵，在發酵時應填加1-3%左右的石灰粉，以調整酸堿度至中性。
兔糞發酵注意事項：
兔子的糞便不能直接當肥料使用，兔糞、尿液中的尿素、氛以及鉀、磷等，均可新鮮使用，都能被植物吸收利用。但糞中的蛋白質等未消化的有機物質，要經過腐熟後轉變成銨離子植物才能吸收。
如果糞便的量很多，可以收集堆在一起讓肥料發酵一段時間才可以用，把糞便裝在容器裏或者用塑料薄膜密封起來，一般要兩個月。發酵完成的兔糞可直接存放，也可以袋裝，存放地點要注意通風幹燥。
兔糞可以減少粘蟲、螻蛄、紅蜘蛛等害蟲的危害；兔糞中的各種成分一直在發酵轉化分解，發酵過程產生的高溫會引發燒根燒苗，並且含有的大量蟲卵和有害菌會汙染土壤環境，危害種植物的生長；而發酵產生的高溫會殺滅這些蟲卵和有害菌。
另外；兔糞中的磷、氮較多，可以提高土壤肥力，改良土壤團粒結構；適用於缺磷的土壤，一般每畝地穴施或條施50-100kg左右。
