農家肥一般包括人糞尿、廄肥、堆肥、綠肥、泥肥、草木灰等。所有的農家肥都需要在堆積腐熟的過程中，通過微生物的作用，腐熟分解成為作物可利用狀態的養分，才能應用在農業生產當中。
農家肥發酵腐熟須知
農家肥發酵腐熟的流程
農家肥充分堆積發酵，需要嚴格按照農家肥發酵的標準流程進行，在發酵過程中要保持適宜的溫度、濕度，並加上好的菌肥或菌劑、粉碎好的秸稈，提高腐熟的效率。發酵的農家肥含水量不要太大，如果過於黏稠需要進行晾曬，如果含水量太少，肥料發幹，需要適當的補充水分。
發酵過程中會產生大量熱量，溫度可高達60~70℃，如果溫度太高，會讓有機質發生分解，損失養分。所以在發酵過程中要適當間隔的對肥料進行翻攪，一般整個發酵過程中翻1~2次為宜。冬季發酵時蓋上的塑料紙不要太嚴。
農家肥發酵腐熟過程中菌的用途
農家肥的有機質經過微生物分解之後釋放出的養分很容易流失，如果長期過度腐熟，這些養分也容易隨著灌溉或者自然降水流失，造成一定的肥料浪費。建議添加一些菌肥或菌劑讓農家肥快速、有效的發酵。有機質的轉化必須有菌的參與，好的菌肥或菌劑可以有效促進肥料的腐熟，並抑製有害菌的生長。
未腐熟的禽畜糞便的危害
要注意；未腐熟的禽畜糞便在土壤中會發酵產生熱量影響作物根係生長甚至燒壞根係，並且含有大量病菌、蟲卵，作物易受病蟲危害。未腐熟的畜禽糞便作物不但不能吸收，還有害作物根係生長發育。
所以要正確辨認農家肥是否已經完全腐熟。首先；完全腐熟好的農家肥相對來說刺鼻的氣味減輕。其次；充分腐熟好的農家肥中的團粒結構鬆散開來。最後；充分腐熟完畢的有機肥在顏色上，相較於未腐熟的顏色更深一些。例如牛糞發酵以前呈草綠色，發酵完成後呈黑炭色。
